Technology
DeepNeo
DeepNeoVxは、Neogenlogicによるパーソナライズされたがんワクチンのためのプラットフォームです。その中核を担うのはDeepNeoパイプラインであり、DeepNeo-MHC、DeepNeo-TCR、およびDeepNeo-BCRを含む一連のAIソリューションで構成されています。単なるMHC結合予測にとどまらず、DeepNeoはT細胞とB細胞の両方を活性化できるネオアンチゲン（新抗原）を特定します。この体系的なアプローチにより、DeepNeoVxは個々の患者のがんに対して最適なワクチンを設計する、世界で最も進んだシステムを確立しています。
- Neogenlogic独自のAIシステム「DeepNeo」は、免疫原性が検証された腫瘍特異的ネオアンチゲンを特定し、それらを標的とするmRNAまたはペプチドベースの治療用ワクチンを設計します。
- DeepNeoシステムは、MHC結合親和性とT細胞反応性を予測するDeepNeo-MHC/TCRモジュールと、B細胞反応性を予測するDeepNeo-BCRモジュールで構成されています。
- 真のネオアンチゲン（新抗原）の特定を目指すDeepNeoシステムは、既存のアルゴリズムと比較してコスト効率に優れ、高精度なネオアンチゲン予測を提供します。特に、MHCクラスII結合およびB細胞反応性の予測において、顕著な性能向上を実現しています。
DeepNeo-MHC/TCR
- DeepNeo-MHC/TCRは、MHCとの物理的結合を予測するDeepNeo-MHCと、T細胞免疫応答を予測するDeepNeo-TCRの2つのモジュールで構成されています。
- タンパク質の構造情報に基づき、MHC結合強度と免疫原性の両方を予測します。
DeepNeo-BCR
- DeepNeo-BCRは、大規模なヒトB細胞受容体（BCR）配列を収集して最も重要なクローンを抽出し、体細胞超変異（somatic hypermutation）データを組み込むことでこれらをモデル化します。
- ペプチドとB細胞受容体（BCR）の結合、およびそれに伴う免疫応答は、タンパク質構造情報を用いて予測されます。
